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扩增子测序

来源: 本站原创    作者:佚名   发布时间:2015/3/31 11:51:24

 扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。扩增子测序能够根据不同需求,对目标区域进行高覆盖度的测序,还可以检测到低频突变。目前扩增子测序主要包括针对功能基因的测序、靶向序列定向捕获片段的测序和甲基化片段测序等类型。 

一、技术路线

Illumina MiSeq   Roche 454 FLX+

二、生物信息分析

 

1. 原始数据整理、过滤及质量评估 

 

2. 序列比对与分析:
    ♦与参考序列比对
      ♦SNPs和InDel的检测

 

3. 根据客户需求进行个性化分析

 

三、结果展示

 

  

 

四、样品要求

 

1.请您提供NanodropGel-Electrophotometric或者Agilent中一种或多种形式的样品分析结果。

 

2.样品纯度要求:OD值应在1.82.0之间;电泳检测无明显非特异性杂带,PCR产物条带清晰、完整。

 

3.样品浓度:纯化后PCR产物浓度不低于5 ng/ul

 

4.样品总量:样品总量不低于200 ng

 

5.样品信息:请仔细填写DNA样品信息表,提供DNA样品具体浓度、体积、制备时间、溶剂名称及物种来源。请同时附上QC数据,包括电泳胶图、分光光度或Nanodrop仪器检测数据。 如需进行多次样品制备,需要提供多次样品制备所需样品。

 

6.送样管务必标清样品编号,管口使用Parafilm膜密封。

 

7.寄送样品需要保持低温环境,最好的方法是冻干邮寄,其次是溶于TE,当然也可以溶于双蒸水。

 

五、迪巧的优势

 

1.迪巧生物拥有多个高通量测序平台,其中Illumina MiSeq平台具有读长长,速度快,灵活性强,尤其适合于扩增子测序,可以保证数据的准确性以及变异位点的发现。

 

2.可定制个性化的测序及分析方案,根据实际客户需求,深度定制方案。

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